共有ライブラリを生成したときに NDK では Map ファイルをデフォルトでは生成しないです。
jni/Android.mk に
LOCAL_LDFLAGS += -Wl,-Map,$$(LOCAL_OBJS_DIR:%/=%)/$(LOCAL_MODULE).map -Wl,--cref -Wl,--demangle
を追加することで Map ファイルを生成するようになります。
出力される so と同じ箇所に出力する場合は
LOCAL_LDFLAGS += -Wl,-Map,$$(LOCAL_BUILT_MODULE:%/=%).map -Wl,--cref -Wl,--demangle
でいけます。